Операционная система NetWare имеет ограниченные возможности по разработке приложений:
имеется небольшое число средств для разработки NLM-модулей (в основном компилятор Watcom C),
в NetWare 3.х нет встроенных средств защиты оперативной памяти (ОП) задачи (нити); в NetWare 4.х эта защита реализована только между двумя доменами (кольцами) ОП файлового сервера,
нет средств организации на файловом сервере виртуальных машин,
многопроцессорную обработку поддерживают только операционные системы NetWare 4.1 SMP и NetWare SFT III, причем возможности последней ОС весьма ограничены,
не реализована встроенная распределенная файловая система,
ОС не поддерживает удаленные процедуры.
С целью устранения перечисленных недостатков фирма Novell разработала UNIX-подобную ОС UnixWare. Это связано с тем, что операционная система UNIX не имеет отмеченных выше ограничений.
NetWare имеет и некоторые другие недостатки:
для администрирования необходимо иметь рабочую станцию,
ОС поддерживает персональные компьютеры с Intel-совместимым процессором,
при инсталляции операционная система не распознает автоматически параметры сетевых адаптеров и периферийных устройств, их следует указывать вручную.